衛星DNA
衛星DNA(satellite DNA)是一類高度重復序列 DNA在介質氯化銫中作密度梯度離心,離心速度可以高達每分鐘幾萬轉;此時DNA分子將按其大小分布在離心管內不同密度的氯化銫介質中,小的分子處于上層,大的分子處于下層;從離心管外看,不同層面的DNA形成了不同的條帶。根據熒光強度的分析,可以看到在一條主帶以外還有一個或多個小的衛星帶。這些在衛星帶中的DNA即被稱為衛星DNA,這種DNA的GC含量一般少于主帶中的DNA,浮力密度也低。
衛星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四類,其浮力密度分別是1.687,1.693,1.697和1.700 g/cm3。各類衛星DNA都是由各種不同的重復序列家族所組成。衛星DNA通常是串聯重復序列。衛星DNA按其重復單元的核苷酸的多少,可以分為兩類。一類是小衛星DNA(minisatellite DNA),由幾百個核苷酸對的單元重復組成。另一類是微衛星DNA(microsatellite DNA),由2個到20個左右的核苷酸對的單元重復成百上千次所組成。衛星DNAI家族由42bp的單元組成,其中17bp(ACATAAAATAT AAAGT)為可變區,25 bp(ACCCAAAAAGT TATTATATACTGT)為重復單元。衛星DNAⅡ家族是保守性差的ATTCC重復。衛星DNAⅢ是較保守的ATTCC重復,且與10bp的序列(A TCGGGTTG)相間分布。衛星DNA還有另一些分類的名稱,如α衛星DNA是靈長類特有的單元為171 bp的高度重復序列,最初是在非洲青猴基因組中發現,現在已確定分布在人染色體的著絲粒區。β衛星DNA家族是單元為68bp的串聯重復序列,富含GC。γ衛星DNA是220 bp的串聯重復。第Ⅳ類衛星DNA稱為隱藏的衛星DNA(cryptil satellite)。這是包含了多種串聯重復序列的DNA分子,離心時并不像衛星DNA那樣也分開,但它的屬性卻類似衛星DNA。
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