蛋白質剪接
定義
蛋白質剪接是發生在翻譯后水平的自催化加工過程,由前體蛋白質中保守的特殊氨基酸序列--內含肽(intein)介導,稱為蛋白質內含子介導的蛋白質剪接。該過程不需要蛋白催化酶和其它輔助因子的參與,但受到環境的影響。
前體蛋白和成熟蛋白
蛋白質翻譯后并不直接發揮作用,稱為前體蛋白,沒有活性。前體蛋白經過剪切重接后稱為成熟蛋白,發揮活性,例如參與焦亡的CASP1、GSDMD蛋白等。通常Western Blot 實驗中,采用抗體檢測可發生自剪切的目標蛋白時,PVDF 膜上會出現多條分子量不同的目的蛋白條帶,包含前體蛋白和其剪切后的活性蛋白形式。科研實驗中通常檢測的是其活性剪切蛋白形式。
蛋白剪接條件
反應亦不需要任何輔助因子、酶和ATP能量,其催化結果是將內含肽兩側的外顯肽通過肽鍵連接成成熟的天然肽。內含肽(intein)是蛋白質肽鏈中插入的序列。作為蛋白質水平而不是RNA水平剪切的結果,它們在核酸水平上存在,在成熟的基因產物中消失。[1]
蛋白內含肽與剪接
蛋白內含肽(intein),是指一個蛋白質前體中的多肽序列,可以催化自身蛋白質前體中斷裂,使兩側的蛋白質外顯肽連接成成熟的蛋白質。
它是位于宿主蛋白質中的一段插入序列,前綴 in 取自inventing, 后綴 tein 取自 protein。與內含肽相對應的另一專用術語是外顯肽。
內含肽基因與宿主蛋白基因存在于同一開放閱讀框架(open reading frame,ORF)內,它不是一個獨立的基因,也不同于內含子基因。內含子基因在轉錄水平被剪切而不翻譯,內含肽基因插入于外顯肽基因,與宿主蛋白質基因進行同步轉錄和翻譯,其對應的核苷酸序列嵌合在宿主蛋白對應的核酸序列之中,隨后自發進行剪切。
內含肽可從前體蛋白中自主切除,并將兩側外顯肽斷端連接起來成為成熟蛋白質。即為當翻譯形成蛋白質前體后,內含肽從宿主蛋白質中切除,從而形成成熟的具有活性的蛋白。
內含肽剪接特性
現有的剪接機理假說, 蛋白質剪接反應主要依靠1位 (蛋白質內含子N 端第一位氨基酸)和正1位(C 端蛋白質外顯子 N 端第一位)的氨基酸, 認為這兩個位點的氨基酸對于發生蛋白質剪接至關重要。[2] 但目前對內含肽作用仍然存在許多疑問,尤其是如何構建含內含肽的前體蛋白高活性剪切體。
參考文獻
【1】宋利萍,黃華樑.蛋白質剪切及其應用[J].生物工程學報,2003(02):249-254.DOI:10.13345/j.cjb.2003.02.026.
【2】Volkmann Gerrit and Liu Xiang-Qin. Intein lacking conserved C-terminal motif G retains controllable N-cleavage activity.[J]. The FEBS journal, 2011, 278(18) : 3431-46.


